El edificio está ubicado en una pintoresca y pequeña plaza, en el centro real de Bolonia, junto a un área que una vez se usó como cárcel y ahora alberga el Departamento de Historia de la Universidad de Bolonia.

La historia de esta iglesia, como la de la cercana Complesso di Santo Stefano, hace referencia a la simbología de los lugares sagrados en Jerusalén. La iglesia redondeada del siglo V solía albergar una Congregación de los Canónigos Regulares de Letrán, fue restaurada en 1200 y se le dio un estilo gótico alrededor de la segunda mitad del siglo XV.
La elegante fachada recuerda el estilo de Veneto y Ferrara (1474); en su entrada hay un águila vigorosa, el emblema del evangelista Juan, moldeado por Nicolò dell'Arca (c. 1481). El edificio interior tiene tres naves, valiosas paredes de vidrio (siglo XV), preciosas piezas que datan de los siglos XIV y XVIII, el coro de los siglos XVI y una columna peculiar con una capital volcada, en cuyo fondo se encuentra una cruz románica. a la antigua capilla de San Petronio (el Cristo arbolado se remonta al siglo XVI).
En el pasado, la iglesia albergaba algunas pinturas de Ercole de 'Roberti, Domenichino, Cima de Conegliano, Perugino, junto con una copia de la famosa Estasi di Santa Cecilia de Raffaello, cuya copia original ahora se exhibe en la Pinacoteca Nazionale di Bolonia (Galería Nacional de Arte de Bolonia).