Das Museum für Naturkunde des Mittelmeers ist nicht weit vom Giovanni Fattori Civic Museum entfernt. Es befindet sich in der historischen Villa Henderson und ist über die CTT-Nord-Linie (ehemals ATL) mit Haltestellen in der Via Roma oder der Piazza Matteotti erreichbar.

Die Ursprünge des Museums reichen bis in das Jahr 1929 zurück, als das reichhaltige Material im Kabinett des Vespucci Technical Institute erworben wurde. Nach dem Zweiten Weltkrieg, der zum Verlust der Sammlung führte, wurde das Museum im Städtischen Aquarium Diacinto Cestoni wiedereröffnet und 1980 in die Villa Henderson-Zentrale verlegt.

Die Villa gehörte Antonio Orlandi im Jahr 1762 und ging später an die Filippi, Guebhard und dann an den Webb James über. Nachdem es 1917 zur Familie Bracchini gehörte, ging es in den Besitz von George Henderson über, dessen Familie seit Ende des 18. Jahrhunderts der britischen Gemeinde der Stadt gehörte. Nach seinem Tod im Jahr 1934 ging das Gebäude, das damals aus dreißig Räumen und einem großen Park bestand, an die Provinzverwaltung von Livorno über. Der Garten hat noch immer den typischen englischen Grundriss erhalten, der im späten 18. Jahrhundert entstanden ist. Bemerkenswert sind die Baumarten, die mit einem sechseckigen Brunnen und einer kleinen Steinhöhle mit drei kleinen Bögen, die mit spontaner Vegetation bedeckt sind, die Umgebung bereichern, die am Eingang von einer jahrhundertealten Kiefer dominiert wird.

Der heutige Komplex besteht aus der eigentlichen Villa, in der sich die Verwaltungsbüros befinden, und dem neuen, auf drei Etagen entwickelten Abschnitt, der 4 Strecken umfasst, die in drei Ausstellungshallen unterteilt sind: der Sala dell'Uomo, der Sala der Geopaleontologie der Sala dell'Uomo nel Mediterraneo, der Raum für vergleichende Anatomie der Wirbeltiere. Ein fünfter Weg, der 2009 eingeweiht wurde, betrifft die Flucht in der Natur und bietet einen Überblick über die Strategien, die von Pflanzen- und Tierorganismen von der Urzeit bis zur Gegenwart entwickelt wurden. Im selben Komplex befinden sich das Planetarium und ein Auditorium (mit über 100 Plätzen), das mit den modernsten Geräten für Ton- und Bildwiedergabe ausgestattet ist. Innerhalb des historischen Gartens befindet sich das Gebäude, in dem sich die historisch-wissenschaftliche Bibliothek befindet. Mit einer Sammlung von ungefähr 5.000 Bänden und mehr als 400 Zeitschriften, katalogisiert und nach Absprache für die Öffentlichkeit zugänglich, ist es ein ausgezeichnetes Dokumentationszentrum und eine Datenbank für den Mittelmeerraum.
Ebenfalls im historischen Garten befindet sich der Invertebrate Room, der den zahlreichen Arten lebender Wesen gewidmet ist, die zur Kategorie der wirbellosen Wassertiere und der Landtiere zählen, sowohl primitiv als auch weiterentwickelt: Ein Teil des Raums betrifft Meeresarten (z Schwämme, Weichtiere, Stachelhäuter), während ein zweiter Sektor Landarthropoden umfasst (z. B. Spinnentiere, Käfer, Odonate und andere).

Im Sea Room werden neben Dioramen, die den Meeresboden des Mittelmeers rekonstruieren, eine Reihe von Skeletten von Meereswalen gezeigt, unter denen ein Exemplar eines gewöhnlichen Wals steht, der 1990 in Piombino gefunden wurde Da es sich in der Öffentlichkeit der Öffentlichkeit widmet und in seiner konstruktiven Architektur an seine Form erinnert, bietet es eine umfassende Dokumentation aller Arten von Fischen, Säugetieren, Schildkröten und Vögeln des Mittelmeers.

Im Jahr 2003 wurde das Umweltbildungszentrum eingeweiht, das aus einer Reihe von Laboratorien besteht, die mit den modernsten Geräten ausgestattet sind: in den Räumlichkeiten dieses Mehrzweckzentrums, das den Bildungsbereich des Museums, das Institut, darstellt Das Museum kann nicht nur für das Gebiet der Provinz, sondern in einem viel größeren Bereich eine ganze Reihe von Aktionen fördern, die darauf abzielen, die Bildung für die Umwelterziehung zu verbessern: Das Zentrum reicht von der Botanik bis zur Zoologie, von der Chemie bis zur Archäologie von der Genetik bis zur Anthropologie.
Das Museum ist mit dem Germplasm Conservation Laboratory ausgestattet, das 2009 in der bestehenden Struktur erweitert wurde, in dem eine Samenbank der wichtigsten mediterranen Arten computergesteuert gelagert und gelagert wird. Die Tätigkeit, die in diesem Sektor ausgeübt wird, zielt vor allem auf den Schutz der vom Aussterben bedrohten Arten ab und verfügt über aktive Austauschkanäle mit anderen europäischen Keimplasmabanken.

Es gibt auch einen botanischen Garten, der die Außenräume der Museumsräume darstellt. Es schlägt die Flora des Mittelmeerbeckens erneut vor, insbesondere in Bezug auf die Provinz Livorno und das Archipel