Das Diözesanmuseum Mantua befindet sich auf der Piazza Virgiliana im Kreuzgang des ehemaligen Klosters Sant'Agnese.
Während des XIV. Jahrhunderts gründeten die Anhänger des seligen Mantuanischen Giovanni Bono (1168-1249) in seiner Stadt vor den Toren Civitas das große Augustinerkloster Sant'Agnese, das auch reich an Kunstwerken war. Das Kloster wurde bald sehr prestigeträchtig und beherbergte den heiligen römischen Kaiser Karl V. 1530 und 1532; dann investierte er den Abt und seine Nachfolger als Zählimpulse.
Nach der Unterdrückung von Klöstern aus dem 18. Jahrhundert wurde das Kloster Sant'Agnese entweiht und die Kirche niedergerissen. Die Diözese löste es Mitte des 20. Jahrhunderts aus und machte daraus ein Internat.
Das heutige Museum befindet sich im ersten Stock, während sich mehrere Diözese-Organisationen im Erdgeschoss befinden.
Heute hat das ehemalige Kloster eine neoklassizistische Fassade von Paolo Pozzo (1795) und ist nur wenige Schritte vom Herzogspalast und der Kathedrale entfernt.

Das Museum ist dem ehrwürdigen Francesco Gonzaga gewidmet, der von 1593 bis 1620 Bischof von Mantua war und ein großer Förderer heiliger Kunst war. Es beherbergt viele Kunstwerke der letzten 20 Jahrhunderte, darunter Skulpturen, Gemälde, Wandteppiche, sakrale Möbel und Juwelen aus der Kathedrale und der Basilika Santa Barbara, Emails aus Glas, Keramik und so weiter; diese Objekte stammen nicht nur aus Diözesanpfarreien, sondern auch aus Byzanz, dem Nahen Osten, Wien, Paris ...
Hier einige Kunstwerke:
- das berühmte beleuchtete Missal von Barbara von Brandenburg;
- die Mehrheit der noch verbliebenen italienischen Rüstungen aus dem XV. und XVI. Jahrhundert;
- Werke von Mantegna, Correggio, Cellini, Fetti, Borgani, Annigoni, Lanfranco und die größte Sammlung von Bazzanis Gemälden; Elfenbein aus dem Mittelalter und der Renaissance;
- die größte Sammlung von Limoges-Emails aus dem 12. und 20. Jahrhundert;
- Die Mehrheit der noch erhaltenen wertvollen sakralen Möbel der Familie Gonzaga