El Museo Diocesano de Mantua se encuentra en Piazza Virgiliana, en el claustro del antiguo monasterio de Sant'Agnese.
Durante el siglo XIV, los seguidores del beato mantuano Giovanni Bono (1168-1249) fundaron en su ciudad, justo en las afueras de civitas vetus, el gran monasterio agustiniano de los santos agneses, que también era rico en obras de arte.
El monasterio pronto se convirtió en muy prestigioso y fue sede del Sacro Emperador Romano Carlos V en 1530 y en 1532; entonces, invirtió el abad y sus sucesores como cuentas.
Después de las supresiones de conventos del siglo XVIII, el monasterio de Sant'Agnese fue desconsagrada y su iglesia fue derribada. La diócesis lo rescató a mediados del siglo XX y lo convirtió en un internado.
El museo actual está en el primer piso, mientras que varias organizaciones de la Diócesis están en la planta baja.
Hoy en día el antiguo monasterio tiene una fachada neoclásica de Paolo Pozzo (1795), y está a pocos pasos del Palacio Ducal y la Catedral.

El museo está dedicado al venerable Francesco Gonzaga, obispo de Mantua desde 1593 hasta 1620, y un gran promotor del arte sacro. Alberga muchas obras de arte de los últimos 20 siglos, como esculturas, pinturas, tapices, muebles sagrados y joyas de la catedral y la basílica de Santa Bárbara, esmaltes vítreos, cerámica, etc. Esos objetos no solo provienen de parroquias diocesanas, sino también de Bizancio, Oriente Medio, Viena, París ...
Estas son algunas de sus obras de arte:
- el famoso Misal iluminado de Bárbara de Brandeburgo; br> - la mayoría de las armaduras italianas restantes de los siglos XV y XVI;
- obras de Mantegna, Correggio, Cellini, Fetti, Borgani, Annigoni, Lanfranco y la mayor colección de pinturas de Bazzani;
- una gran colección de marfil medieval y renacentista;
- la colección más grande de esmaltes vítreos de Limoges, con edades entre los siglos XII y XX;
- la mayoría de los preciosos muebles sagrados de la familia Gonzaga