Die Chiesa di San Francesco (italienisch "Kirche des Hl. Franziskus") ist eine römisch-katholische Kirche, die 1304 vom Franziskanerorden gegründet wurde, aber erst 1459 geweiht wurde, als Papst Pius II. Die Zeremonie durchführte.

Im Jahr 1782 unterdrückt, wurde es 1797 während der Napoleonischen Kriege geplündert und 1811 in ein Arsenal verwandelt. Als der Zweite Weltkrieg begann, war es immer noch militärisch im Einsatz und wurde während des Krieges durch Bombardements zerstört. Die Cappella Gonzaga mit ihren Fresken, die das Leben von St. Louis von Toulouse (italienisch: San Ludovico d'Angiò) darstellen, wurde gerettet und kürzlich restauriert. Diese Fresken sollten von Serafino de 'Serafini gemalt worden sein, einem Künstler, der im 14. Jahrhundert in Modena tätig war. Die Kirche wurde im romanischen und gotischen Stil rekonstruiert. Jetzt sind einige der Originalfresken zu sehen, die den Hl. Franziskus zeigen. Erhält die Stigmata von Stefano da Verona. Andrea Mantegnas Werk St. Bernardino von Siena zwischen Two Angels war ursprünglich hier, aber jetzt in der Pinacoteca di Brera in Mailand, Italien.

In der Cappella Gonzaga, zwischen 1369 und 1484 erbaut, wurden begraben: Guido Gonzaga, 2. Capitano del Popolo von Mantua, Ludovico II Gonzaga, 3. Capitano del Popolo von Mantua, Francesco I. Gonzaga, 4. Capitano del Popolo von Mantua, Margherita Malatesta, zweite Frau von Francesco I. Gonzaga, Gianfrancesco Gonzaga, 5. Capitano del Popolo von Mantua, Rodolfo Gonzaga, Sohn von Ludovico III, 2. Marquis von Mantua, Francesco Kardinal Gonzaga, Sohn von Ludovico III, 2. Marquis von Mantua.

Auch an der Kirche wurden andere bemerkenswerte Persönlichkeiten bestattet: Giovanni dalle Bande Nere, der Condottiero, 1526 in voller Rüstung begraben, der selige Alberto Gonzaga 1321, Guido Torelli, der Gründer der Adelsfamilie von Torelli, 1449 , Cristoforo I Torelli, Sohn von Guido, im Jahre 1460, Francesco Secco, der Condottiero, dem die Familienkapelle gehörte, im Jahre 1496.