Am 7. Juni 1981 wurde der Erzbischof von Bari Mons. Mariano Magrassi errichtete das Diözesanmuseum in Bari. Die Absicht wurde durch das Diktat des II. Vatikanischen Ökumenischen Konzils inspiriert, um zu vermeiden, dass "die heiligen Einrichtungen und Werke, die kostbare Schmuckstücke aus dem Haus Gottes sind, verkauft oder zerstreut werden". Ursprünglich diente es als Aufbewahrungsort für Kunstwerke und heilige Einrichtungsgegenstände aus verlassenen Kirchen der antiken Stadt Bari und der gesamten Diözese. Das Museum wurde am 16. Juni 1983 offiziell eröffnet. Am 12. September 1996 wurde die erste Ausstellung der Schatzkammer, der Exultet-Halle und der Kunstgalerie geschaffen. Am 11. September 1998 wurde auf der zweiten Parzelle die Errichtung des Lapidars der Segenshalle, der Exultet II und III sowie der Halle der Kirchengewänder eingeweiht. Nach der Vertreibung der Curia-Büros durch Erzbischof Francis Cacucci wurde der verbleibende Bereich des ersten Obergeschosses als Museum konzipiert.