Uniwersytet w Pawii Museo di Storia Naturale został utworzony w 1771 roku na polecenie Marii Teresy z Austrii, która mianowała go dyrektorem Lazzaro Spallanzaniego, przewodniczącego historii naturalnej. Pod jego przewodnictwem zbiory znacznie wzrosły dzięki zakupom, wymianom i darowiznom, a muzeum wkrótce stało się jednym z najbardziej znanych tego typu w Europie.

W XIX wieku nastąpił drugi okres świetności wraz z dalszą ekspansją zbiorów, zwłaszcza dzięki wkładom wielkich odkrywców.

Muzeum mieści obecnie starożytny materiał w różnych pomieszczeniach. Sekcja zoologiczna obejmuje tysiące wypchanych ptaków i ssaków, liczne płazy, gady i ryby zakonserwowane w płynie oraz bardzo bogatą kolekcję owadów.

Sekcja anatomii porównawczej obejmuje przygotowania narządów i szkieletów, a ważna sekcja paleontologiczna może pochwalić się ponad 30 000 okazów zwierząt i roślin kopalnych.