Das Museum befindet sich innerhalb des zentralen Universitätsgebäudes und überblickt den Innenhof der gefallenen alten medizinischen Innenhöfe der Universität.

Es wurde 1936 eingeweiht und bewahrt Manuskripte, gedruckte Texte, anatomisch und naturalistisch vorbereitete wissenschaftliche Instrumente, die ein Zeugnis der Geschichte der Universität aus ihrem mittelalterlichen Ursprung darstellen.

In der zweiten Hälfte des XVIII. Jahrhunderts wurde die Universität von Pavia nach den Reformen der österreichischen Kaiserin Maria Teresa zu einem der avantgardistischsten wissenschaftlichen Zentren Europas Ursprüngliche Kernstücke der Hauptsammlungen, der Physikabteilung, versammelten sich um die Instrumente des alten Labors von Alessandro Volta und der Medizinabteilung, Erbe der anatomischen Sammlungen, die Antonio Scarpa in den Räumlichkeiten des Museums eingerichtet hatte.

In der Abteilung für Medizin, die in drei Räume unterteilt ist, werden Instrumente und Präparate aufbewahrt, die sich auf die Tätigkeit der anatomischen Schule von Antonio Scarpa und auf das Naturkundemuseum von Lazzaro Spallanzani beziehen, die beide in Pavia angekommen sind Ende des achtzehnten Jahrhunderts, um auf dem Gebiet der Chirurgie und der Klinik durch das neunzehnte und zwanzigste Jahrhundert voranzukommen, mit Persönlichkeiten wie Luigi Porta und Carlo Forlanini und der Tätigkeit der von Camillo Golgi gegründeten wissenschaftlichen Schule, die 1906 der erste Italiener wurde - der Nobelpreis für Medizin dank der Entwicklung einer histologischen Methode, die die Grundlagen der modernen Neurowissenschaft legte.

In der Physikabteilung wurde das Physikkabinett von Alessandro Volta rekonstruiert, das sich ursprünglich im ersten Stock befand und das juristische Portal überblickte, in Räumen neben dem physischen Theater.

Unter der Leitung von Volta wurde das Kabinett ab 1778 mit den neuesten Instrumenten für Lehre und Forschung ausgestattet und wurde von zahlreichen italienischen und ausländischen Besuchern bewundert. Ein zweiter Raum beherbergt die Instrumente, die Voltas Nachfolger im 19. Jahrhundert benutzten.

Das Museum beherbergt auch ein Archiv, das einen chronologischen Bogen vom Anfang des 15. bis zum 20. Jahrhundert abdeckt. Die für die Geschichte der Medizin besonders interessante Dokumentation stellt eine wichtige Integration dessen dar, was im Staatsarchiv von Pavia (dem alten Archiv der Universität) und im Historischen Archiv der Universität aufbewahrt wird.